48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3460 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 
80 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  82.5 
 
 
80 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  59.72 
 
 
72 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  66.67 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  42.11 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  71.79 
 
 
89 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.42 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  64.29 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  56 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  42.11 
 
 
92 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  40.26 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4067  putative virulence-associated protein  39.47 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  39.73 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.47 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4299  putative virulence-associated protein  39.47 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  48.98 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.21 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  38.36 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  50.65 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  43.33 
 
 
76 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  43.33 
 
 
76 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  50.91 
 
 
82 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  51.52 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  46.05 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  39.47 
 
 
92 aa  50.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  44.44 
 
 
87 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.98 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  50 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  40.23 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  45.83 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  51.92 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  38.6 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.21 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.72 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.72 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  32.84 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  32.05 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  31.34 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  33.8 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  51.11 
 
 
86 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.37 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  29.49 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  39.02 
 
 
79 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  28.21 
 
 
78 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  39.02 
 
 
79 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>