23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8107 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  100 
 
 		 75 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  53.16 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  53.16 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  48.15 
 
 		 82 aa  60.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  44.3 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  37.18 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  45 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.28 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  36.36 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  41.18 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.47 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  36.71 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.5 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  40.85 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.33 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  38.46 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  40.85 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  34.43 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  41.79 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  39.53 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.31 
 
 		 80 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  45.65 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  37.84 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>