25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1622 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  100 
 
 		 93 aa  186  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  70.37 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  45.45 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  46.75 
 
 		 87 aa  70.1  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.86 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  45.45 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  45.45 
 
 		 76 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  46.67 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  38.16 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  41.56 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  41.56 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  38.16 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  37.18 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.26 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0137  SpoVT/AbrB-like protein  43.55 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  42.37 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  36.36 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  39.19 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  36.11 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  35.06 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  37.84 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.08 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0264  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  52.17 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  43.18 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.93 
 
 		 88 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>