42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5366 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  100 
 
 		 76 aa  154  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  63.16 
 
 		 76 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  63.16 
 
 		 76 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  50 
 
 		 82 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  45.45 
 
 		 93 aa  62  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  44.3 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  39.74 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.05 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.32 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.18 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  41.94 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  37.97 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  37.66 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.94 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  35.9 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  37.66 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.84 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.84 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  39.24 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  39.19 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  43.64 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  33.33 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.55 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  41.67 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  46.51 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  37.97 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.5 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  44 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  56.41 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  37.5 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.5 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  35.71 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.51 
 
 		 89 aa  42  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  35.71 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  29.87 
 
 		 87 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  32.47 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  40 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  35.09 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  38.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  47.22 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  37.84 
 
 		 102 aa  40  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  36.92 
 
 		 86 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>