40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6254 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 
80 aa  159  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  93.75 
 
 
80 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  60.56 
 
 
78 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  56.94 
 
 
77 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  56.47 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  59.42 
 
 
79 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  55.29 
 
 
90 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  53.73 
 
 
78 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  55.22 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  55.22 
 
 
79 aa  74.7  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.56 
 
 
87 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  48.1 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  54.43 
 
 
111 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  48 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  48.05 
 
 
81 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  46.15 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  44.74 
 
 
102 aa  60.1  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  35.71 
 
 
100 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  44.83 
 
 
86 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  39.39 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.33 
 
 
89 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  39.74 
 
 
82 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  45.1 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.72 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.72 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  34.43 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  37.5 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  46.15 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  41.67 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  41.67 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.67 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  36.67 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  40.98 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  46.15 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.1 
 
 
87 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  32.31 
 
 
75 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  37.21 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.24 
 
 
88 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.24 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.48 
 
 
77 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>