31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0152 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 86 aa  177  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  68.67 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  60.24 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  59.26 
 
 		 86 aa  94  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1432  virulence-associated protein  56.34 
 
 		 71 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  52.33 
 
 		 87 aa  84.7  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  52.38 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  41.11 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  53.42 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3758  SpoVT/AbrB-like protein  45.98 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067514  normal  0.0222413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50.68 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  46.15 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  46.15 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  46.25 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  63.27 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.11 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  56.45 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  66.67 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  56.45 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  53.06 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  50.77 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  37.97 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  79.31 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  44 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  46 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  47.37 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  46.05 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  52 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  44.59 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  34.33 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>