31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2367 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  174  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  60.71 
 
 
86 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  61.25 
 
 
96 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  57.5 
 
 
87 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  59.26 
 
 
86 aa  94  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50.59 
 
 
87 aa  81.3  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  73.21 
 
 
86 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  46.43 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1432  virulence-associated protein  46.97 
 
 
71 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  47.56 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50.88 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  42.5 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3758  SpoVT/AbrB-like protein  45.68 
 
 
88 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067514  normal  0.0222413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  41.03 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  41.03 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  48.15 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  37.66 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  52.38 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  46.3 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  52.38 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  49.12 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  59.52 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  61.54 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  41.43 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  60.53 
 
 
89 aa  47  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  45.61 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  43.06 
 
 
72 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  43.94 
 
 
80 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  40 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  58.06 
 
 
92 aa  40  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>