30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3733 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  100 
 
 		 100 aa  203  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  44.05 
 
 		 81 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  37.36 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  41.89 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  42.05 
 
 		 92 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  43.04 
 
 		 77 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  42.25 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.51 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.53 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  42.86 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  42.47 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.9 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.71 
 
 		 80 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  32.99 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  35.94 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  34.94 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  34.94 
 
 		 79 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  35.62 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  47.17 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.79 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  54.05 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  44.59 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  54.29 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.99 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  43.75 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  51.35 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  45.61 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  54.29 
 
 		 106 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  27.27 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  51.43 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>