28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1510 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  69.14 
 
 
86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  63.75 
 
 
96 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  60.71 
 
 
86 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  58.75 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.29 
 
 
87 aa  88.2  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1432  virulence-associated protein  50 
 
 
71 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  43.18 
 
 
110 aa  67  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 
86 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3758  SpoVT/AbrB-like protein  46.25 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067514  normal  0.0222413 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  49.23 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  44.78 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  44.44 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  44.44 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  53.23 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  53.23 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  37.66 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  50.82 
 
 
80 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  58.82 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  66.67 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.71 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  66.67 
 
 
106 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  60.61 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  65.52 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  39.71 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  64.52 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  40.62 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  39.29 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>