23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3379 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  100 
 
 		 87 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  77.01 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  60.24 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  58.75 
 
 		 86 aa  97.4  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  57.5 
 
 		 86 aa  97.1  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.43 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1432  virulence-associated protein  40.85 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  58.93 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3758  SpoVT/AbrB-like protein  44.19 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067514  normal  0.0222413 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  38.1 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  38.46 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  38.46 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  48.08 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.08 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.28 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  56.41 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  46.94 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  41.38 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  29.87 
 
 		 76 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  53.49 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  64.29 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  38.46 
 
 		 82 aa  40  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  41.51 
 
 		 75 aa  40  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>