34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1318 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  100 
 
 		 79 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  72.15 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  72.15 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  59.49 
 
 		 79 aa  93.6  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  57.14 
 
 		 78 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  55.88 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  57.53 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  50.59 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  53.09 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  54.55 
 
 		 87 aa  80.5  0.000000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  59.42 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  54.05 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  45.45 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50 
 
 		 87 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  42.47 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  47.14 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  61.9 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  47.54 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.44 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.32 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.32 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  35.62 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  53.85 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  43.9 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.59 
 
 		 80 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  38.64 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.59 
 
 		 80 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  31.58 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  51.16 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  51.16 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  35.59 
 
 		 80 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  37.7 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  39.29 
 
 		 86 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>