34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1877 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 87 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  74.67 
 
 		 78 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  75.36 
 
 		 78 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  62.16 
 
 		 77 aa  95.5  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  54.55 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  56.16 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  56.16 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  52.94 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  48.57 
 
 		 81 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  49.37 
 
 		 80 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.1 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  57.63 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  51.25 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  68.18 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  49.37 
 
 		 90 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  37.36 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  44.44 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  66.67 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.1 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  48.78 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  38.96 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  38.16 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  44.64 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  43.14 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  41.43 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.19 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  33.93 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  40 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  43.59 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.68 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  44.68 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.68 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>