45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1544 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 		 88 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  92.05 
 
 		 88 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  86.59 
 
 		 87 aa  141  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  64.47 
 
 		 76 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  60.53 
 
 		 76 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  39.19 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  48.28 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  55.32 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  51.11 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.16 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.16 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.92 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  36.92 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  47.73 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  36.36 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  39.39 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  32.89 
 
 		 77 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  39.19 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  39.06 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  46.81 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  46.67 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.46 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  42.62 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.86 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  41.67 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  40.43 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  46.67 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  36.92 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  46.67 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  33.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  35.8 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  39.08 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  46.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  46.51 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  41.46 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  36.07 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  48.84 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  43.9 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  40.43 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.24 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.24 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  44.68 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  32.31 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>