35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2718 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  100 
 
 		 102 aa  205  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  55.88 
 
 		 102 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  57.14 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  57.14 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  54.12 
 
 		 79 aa  87  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  56 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  57.33 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  52.63 
 
 		 80 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  49.41 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  54.93 
 
 		 87 aa  74.7  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  48.65 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  50.67 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  52 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.71 
 
 		 87 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  42.22 
 
 		 90 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  42.22 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  57.14 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  35.42 
 
 		 100 aa  57  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.86 
 
 		 89 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  39.47 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.73 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  47.73 
 
 		 87 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.73 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  31.03 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  51.28 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  52.63 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  32.43 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  40.91 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  39.53 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  36.36 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  33.9 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.54 
 
 		 77 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  42.11 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  39.47 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  36.36 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>