31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0157 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  100 
 
 		 90 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  82.02 
 
 		 92 aa  142  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  67.07 
 
 		 111 aa  114  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  59.52 
 
 		 87 aa  94  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.29 
 
 		 80 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  56.47 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  53.16 
 
 		 78 aa  70.5  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  48.61 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  49.37 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  59.62 
 
 		 81 aa  62  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  43.48 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  50 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  42.86 
 
 		 100 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  43.59 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  47.37 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  44.29 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  44.29 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  44.16 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  61.9 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  37.88 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  45.61 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.66 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.37 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  38.46 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  37.5 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.26 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  37.5 
 
 		 78 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  36.23 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  53.49 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  39.53 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  45 
 
 		 72 aa  40  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>