37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0482 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 		 87 aa  174  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  59.26 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  59.52 
 
 		 90 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  62.32 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  54.29 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  49.25 
 
 		 78 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.56 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  57.63 
 
 		 87 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.34 
 
 		 80 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  50 
 
 		 79 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  46.75 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  46.75 
 
 		 79 aa  70.1  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  42.53 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  45.45 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  47.76 
 
 		 77 aa  64.3  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  41.77 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  40.22 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  42.53 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  39.71 
 
 		 106 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  44.07 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  37.1 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  37.5 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  46.15 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  34.55 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.74 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  57.14 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  53.85 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  37.5 
 
 		 76 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  32.86 
 
 		 110 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  31.34 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  38.81 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.37 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.37 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.37 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  46.15 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>