32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0153 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 		 78 aa  159  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  93.59 
 
 		 104 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  81.33 
 
 		 78 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  81.33 
 
 		 78 aa  127  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  74.36 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  66.67 
 
 		 87 aa  113  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0137  SpoVT/AbrB-like protein  88.89 
 
 		 64 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  62.07 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.3 
 
 		 94 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  44.87 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  42.86 
 
 		 93 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  47.69 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  38.16 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  46.15 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  37.18 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  34.62 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  38.46 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  38.46 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.62 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2833  hypothetical protein  48 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  42.5 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.38 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.46 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  46.67 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3185  hypothetical protein  44 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  32.35 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  32.31 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  35.9 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  36.47 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  37.5 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.37 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>