16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4123 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  100 
 
 		 79 aa  153  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  40.79 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  38.16 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.16 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  46.3 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  39.29 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  40.82 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  34.67 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  37.5 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.67 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  43.5  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  37.84 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  32.14 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  32.14 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  35.09 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>