26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1128 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 
87 aa  181  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  55.77 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  69.23 
 
 
78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  66.67 
 
 
78 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  56 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  56 
 
 
78 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  69.49 
 
 
109 aa  90.1  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0137  SpoVT/AbrB-like protein  62.3 
 
 
64 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  46.75 
 
 
93 aa  70.1  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.65 
 
 
94 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  39.74 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  40.62 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  46.3 
 
 
79 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  37.5 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.94 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  40.62 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  33.33 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  37.31 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  37.31 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  38.24 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.67 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.67 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  33.33 
 
 
92 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3185  hypothetical protein  47.17 
 
 
170 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762483 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  49.06 
 
 
84 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>