32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3319 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 
104 aa  216  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  93.59 
 
 
78 aa  152  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  80 
 
 
78 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  80 
 
 
78 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  76.92 
 
 
78 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0137  SpoVT/AbrB-like protein  90.48 
 
 
64 aa  118  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  55.77 
 
 
87 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  63.93 
 
 
109 aa  87.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  45.45 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.3 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  46.15 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  40.79 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  47.69 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  39.74 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  39.74 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  39.74 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  46.15 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  34.62 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.62 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  45 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2833  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.38 
 
 
77 aa  47  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  41.18 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3185  hypothetical protein  46 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  37.8 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  34.78 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.81 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3431  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.75 
 
 
86 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.314435  normal  0.150802 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  35.9 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  35.37 
 
 
77 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>