29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0687 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  61.04 
 
 		 77 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  64.94 
 
 		 77 aa  108  3e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  54.55 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  53.25 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  48.05 
 
 		 77 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  40.26 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  45.95 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  44.16 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03914  SpoVT/AbrB-like protein  57.38 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  44.16 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  40.26 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  44.16 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  44.16 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  41.56 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  41.1 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  51.02 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  40.58 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  38.16 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  40 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.06 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  47.06 
 
 		 141 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  31.17 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  43.14 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  31.17 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  31.82 
 
 		 87 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  35.37 
 
 		 104 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>