29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1046 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  100 
 
 		 76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  94.74 
 
 		 76 aa  147  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  72.37 
 
 		 76 aa  120  8e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  72.37 
 
 		 76 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  71.05 
 
 		 76 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  71.62 
 
 		 75 aa  114  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  68.42 
 
 		 76 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  68.42 
 
 		 76 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  64.47 
 
 		 76 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  60.81 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  55.84 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  55.84 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  63.79 
 
 		 94 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  55.84 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  53.25 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  47.37 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  48 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  50.65 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  51.67 
 
 		 69 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  45.95 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  42.42 
 
 		 84 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.96 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.96 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  35.06 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  36.36 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  34.78 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  37.68 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>