28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1324 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  160  4.0000000000000004e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  71.43 
 
 		 77 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  55.84 
 
 		 77 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  57.14 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  55.84 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  45.95 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  46.75 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  48.65 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  42.86 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  44.44 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  45.45 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  41.33 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  44.16 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  44.16 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  37.66 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  41.33 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  36.36 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  37.66 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03914  SpoVT/AbrB-like protein  44.26 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  39.73 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.66 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  33.85 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  34.29 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  35.14 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.47 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  31.17 
 
 		 77 aa  41.6  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  51.61 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>