16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03914 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03914  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 63 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  57.38 
 
 		 77 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  57.38 
 
 		 77 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  52.46 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  44.26 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  34.43 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  40.98 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  40.98 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  37.7 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  37.7 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  31.15 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  34.43 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  31.15 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  32.79 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  34.43 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  29.51 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>