33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1772 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  100 
 
 		 79 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  56.16 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 		 76 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  50 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  50 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  53.42 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  47.3 
 
 		 76 aa  80.1  0.000000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  45.95 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  48.65 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  49.32 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  44.44 
 
 		 76 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  48.61 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  48.61 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  40.26 
 
 		 77 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  45.95 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  43.04 
 
 		 77 aa  71.6  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  49.25 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  40.26 
 
 		 76 aa  67  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  36.99 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  37.33 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.67 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  39.29 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.99 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  30.77 
 
 		 84 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  31.51 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03914  SpoVT/AbrB-like protein  34.43 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  33.33 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  35.94 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  35.38 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  37.5 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.5 
 
 		 88 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  28.38 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>