27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4186 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4186  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.457944 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7374  plasmid maintenance protein MvpT  94.2 
 
 		 76 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  52.94 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  55.38 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3369  putative virulence-associated protein  50 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.75621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  51.47 
 
 		 76 aa  71.6  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2756  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4623  virulence-assiciated protein MvpT  55.38 
 
 		 76 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.587036  normal  0.107873 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2130  virulence-associated protein, putative  50.75 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.0065791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1789  virulence-associated protein, putative  50.75 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.83139  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1046  virulence-associated protein, putative  51.67 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1772  hypothetical protein  49.25 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2670  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0895  SpoVT/AbrB-like  45.59 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277084 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0153  putative plasmid protein  47.69 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2633  hypothetical protein  50.94 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2778  SpoVT/AbrB domain protein  40.3 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.854823  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0687  hypothetical protein  40.58 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  44.62 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1628  SpoVT/AbrB domain protein  40.91 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.427582  normal  0.497743 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1324  hypothetical protein  34.29 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000315591  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28780  hypothetical protein  43.48 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000786477  decreased coverage  0.000000000210809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  37.88 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.23 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.13 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  36.84 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  32.81 
 
 		 76 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>