29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36190 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  100 
 
 		 78 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  76.92 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  74.36 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  69.23 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2914  SpoVT/AbrB-like protein  68 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0141  SpoVT/AbrB-like protein  68 
 
 		 78 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.681017  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0137  SpoVT/AbrB-like protein  75.41 
 
 		 64 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4765  hypothetical protein  68.97 
 
 		 109 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.877642  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  44.87 
 
 		 82 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  45.45 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  47.3 
 
 		 94 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4123  VapB family protein  38.16 
 
 		 79 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0268243  normal  0.453851 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  45.31 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  55.1 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  35.9 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  38.27 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  51.11 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  51.11 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  51.11 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.04 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  36.71 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  37.68 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  37.68 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1193  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  38.81 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.291473 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3431  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  41.38 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.314435  normal  0.150802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.38 
 
 		 77 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.79 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  32.79 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2952  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>