41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0637 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  100 
 
 		 76 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  100 
 
 		 76 aa  153  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  63.16 
 
 		 76 aa  103  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  46.05 
 
 		 82 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  53.16 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  46.15 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.56 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  47.62 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1622  virulence-associated protein vagC, putative  41.56 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  43.21 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.9 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  39.74 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.33 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  41.03 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3319  SpoVT/AbrB-like protein  39.74 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.33 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1510  putative virulence-associated protein  44.44 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.239503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  42.31 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  46.77 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  43.28 
 
 		 86 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  42.86 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3379  SpoVT/AbrB-like  38.46 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0659672  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0153  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.46 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  40.32 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  49.06 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  45 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  44.16 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  37.35 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36190  SpoVT/AbrB-like protein  37.68 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  51.06 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.68 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  38.46 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  37.31 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.812813 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  51.11 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.56 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.67 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  36.36 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3681  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.73 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4732  hypothetical protein  46.34 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.78839  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  37.5 
 
 		 87 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  38.03 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>