27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1096 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1096  virulence associated protein B  100 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  70.67 
 
 		 77 aa  114  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  68 
 
 		 92 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0067  SpoVT/AbrB domain protein  58.44 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  53.33 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  42.67 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  46.58 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.98 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.98 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  44.12 
 
 		 82 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  48.98 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  46.43 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 		 106 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  44.9 
 
 		 80 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0152  SpoVT/AbrB-like protein  40.79 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.887256  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.75 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  41.67 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  48.94 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  48.94 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1462  putative plasmid protein  34.62 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0441  putative plasmid protein  34.67 
 
 		 76 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  37.74 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  50 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0140  plasmid maintenance protein VagC  32.84 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3681  putative plasmid protein  35.06 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>