26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0748 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  168  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  59.76 
 
 
87 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2367  hypothetical protein  42.5 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  40 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.13 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  40.51 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  39.24 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  37.84 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0092  virulence associated protein B  39.24 
 
 
92 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  42.62 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.24 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  37.35 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  37.35 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  32.79 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  38.16 
 
 
87 aa  43.9  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  32.88 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  43.21 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  38.36 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  37.84 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  34.92 
 
 
79 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  34.92 
 
 
79 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  34.38 
 
 
77 aa  41.2  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2062  SpoVT/AbrB-like  33.33 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  40 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1128  SpoVT/AbrB-like protein  49.06 
 
 
87 aa  40  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.812813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>