33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3730 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  100 
 
 		 78 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  83.58 
 
 		 78 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  74.67 
 
 		 87 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  64.71 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  64.71 
 
 		 79 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  61.97 
 
 		 77 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  57.14 
 
 		 79 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  58.97 
 
 		 81 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  58.33 
 
 		 79 aa  87.8  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  59.49 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  60.56 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  56.25 
 
 		 92 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  52 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  49.25 
 
 		 87 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  53.16 
 
 		 90 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.56 
 
 		 111 aa  65.9  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  54.05 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  47.76 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  42.25 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  45.9 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0897  SpoVT/AbrB domain protein  37.84 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.502606  normal  0.0264449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  52.5 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  45.24 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  40 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.26 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  42.62 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  51.28 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  38.36 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  35.71 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  53.12 
 
 		 86 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.86 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.24 
 
 		 77 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>