27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2551 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  100 
 
 		 102 aa  207  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  55.88 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  50.6 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  50.6 
 
 		 79 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  45.45 
 
 		 79 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  44.71 
 
 		 79 aa  62  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  54.05 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.22 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  44.59 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.74 
 
 		 80 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.67 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  48.65 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  43.59 
 
 		 90 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  44.59 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  40.54 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  66.67 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  41.46 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  37.5 
 
 		 86 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.74 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  31.34 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  31.34 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  38.18 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0729  SpoVT/AbrB domain protein  32.73 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.295778  hitchhiker  0.00050185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  38.1 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  27.27 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  38.1 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  42.65 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>