31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2392 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  72.15 
 
 		 79 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  63.29 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  64.71 
 
 		 78 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  57.35 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  52.38 
 
 		 102 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  56.16 
 
 		 87 aa  79.7  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  57.14 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.22 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  50.6 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  55.56 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.75 
 
 		 87 aa  70.1  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  45.95 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  44.29 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  43.33 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.84 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  34.94 
 
 		 100 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  42.86 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  40.98 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40.98 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.72 
 
 		 87 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0748  hypothetical protein  34.92 
 
 		 84 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  36.36 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  41.07 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.51 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.59 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  40 
 
 		 80 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  34.48 
 
 		 110 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>