40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6877 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 		 80 aa  158  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  93.75 
 
 		 80 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  59.49 
 
 		 78 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  58.33 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  54.05 
 
 		 79 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  55.22 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  57.65 
 
 		 92 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  55.56 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  55.56 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  56.47 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  48.68 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  49.37 
 
 		 87 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.34 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  53.16 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  48.72 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  49.35 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  46.67 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  36.9 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  47.06 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.71 
 
 		 89 aa  50.8  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  45.45 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  38.96 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3463  virulence-associated protein-like protein  37.14 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.136649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.72 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  48.72 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0477  virulence protein, putative  37.68 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0637  SpoVT/AbrB domain protein  37.68 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8107  SpoVT/AbrB domain protein  34.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  46.15 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  43.1 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5366  SpoVT/AbrB domain protein  37.5 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511901  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  39.53 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  46.15 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4793  SpoVT/AbrB-like protein  40.98 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0360396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1867  SpoVT/AbrB domain-containing protein  34.78 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  33.33 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2473  virulence associated protein B  51.52 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00364614  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1544  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.24 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.241559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1565  SpoVT/AbrB domain-containing protein  45.24 
 
 		 88 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283133  normal  0.296294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>