32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4146 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4146  SpoVT/AbrB domain-containing protein  100 
 
 		 111 aa  224  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.580775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0443  putative nitrogen regulatory protein NtrP  70.65 
 
 		 92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.208383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0157  SpoVT/AbrB domain protein  67.07 
 
 		 90 aa  114  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0482  SpoVT/AbrB domain-containing protein  62.32 
 
 		 87 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1877  SpoVT/AbrB-like protein  50 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6254  SpoVT/AbrB domain-containing protein  54.43 
 
 		 80 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0237746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6877  SpoVT/AbrB domain-containing protein  53.16 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.755088  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1578  virulence-associated protein  57.41 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.962884  normal  0.0411245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3730  SpoVT/AbrB-like  55.56 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.221101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2718  virulence-associated protein VapB-like  56 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3733  Virulence-associated protein  39.51 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1485  SpoVT/AbrB family protein  38.75 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.659289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2596  SpoVT/AbrB-like protein  60 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4438  SpoVT/AbrB-like  41 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.844975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0796  virulence-associated protein VapB-like protein  50 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4599  putative nitrogen regulatory protein  42.19 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.589266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1318  virulence-associated protein VapB-like protein  44.44 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2551  virulence-associated protein VapB-like protein  41.46 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0335146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2771  SpoVT/AbrB like domain protein  48.84 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.551096  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2392  virulence-associated protein VapB-like protein  48.84 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1682  SpoVT/AbrB-like  47.73 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.134426  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3559  SpoVT/AbrB domain-containing protein  49.02 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4630  SpoVT/AbrB-like protein  47.5 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393791  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0233  SpoVT/AbrB domain-containing protein  39.02 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3906  SpoVT/AbrB domain-containing protein  44.74 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2827  SpoVT/AbrB-like  43.55 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0643594  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1770  hypothetical protein  47.22 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1064  hypothetical protein  44.23 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564884  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3967  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239536  normal  0.337915 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3460  SpoVT/AbrB domain-containing protein  46.15 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910373  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6177  putative virulence-associated protein homologue  36.47 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.576491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0601  SpoVT/AbrB domain protein  41.46 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0989005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>