48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0510 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 89 aa  175  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  73.97 
 
 		 88 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  58.93 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  51.61 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  44.78 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  45.31 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  50.75 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  46.88 
 
 		 112 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  54.39 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  45 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  46.67 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  42.65 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  40 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 94 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  40.62 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  45.71 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  40.32 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  43.64 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2883  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  41.27 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1443  hypothetical protein  53.49 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0602265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 326 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 114 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  41.51 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0716  hypothetical protein  45.28 
 
 		 260 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1856  hypothetical protein  39.62 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2945  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  41.27 
 
 		 324 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.992735 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3211  XRE family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 263 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.663604  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2116  hypothetical protein  29.17 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0098  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  37.88 
 
 		 305 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 258 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 112 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>