80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2426 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  155  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  93.24 
 
 		 74 aa  144  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  32.39 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  36.21 
 
 		 126 aa  47.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  43.4 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  26.76 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  30.16 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  32.26 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  32.88 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  32.86 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4216  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4255  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 333 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000524025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  30.43 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  37.5 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4668  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.443743  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  31.58 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2575  XRE family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 230 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1419  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.138146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 178 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 183 aa  42  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 528 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0440  DNA-binding protein  42.59 
 
 		 91 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000374773  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1453  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 171 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  35.09 
 
 		 93 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 82 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0944  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 189 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  28.57 
 
 		 92 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6814  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  36.21 
 
 		 508 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0410  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 516 aa  42  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 78 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 191 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6340  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2901  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3011  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2377  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 134 aa  41.2  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2601  putative transcriptional regulator  43.64 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0680466  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3038  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2991  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  30 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0032  hypothetical protein  32.79 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.31376e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2562  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 394 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3519  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 210 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0116433 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2985  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 183 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0102  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0467204  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 272 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5123  hypothetical protein  35.09 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.635702  normal  0.639471 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 174 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 205 aa  40.4  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0351  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  36.67 
 
 		 111 aa  40  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.598178  normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0197  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 190 aa  40  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0555347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>