35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1931 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1931  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 88 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4031  XRE family transcriptional regulator  75.9 
 
 		 88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.858841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3102  XRE family transcriptional regulator  70.59 
 
 		 87 aa  123  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5431  transcriptional regulator, XRE family  34.15 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716387  normal  0.867638 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3808  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0020912  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 266 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 188 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3687  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  31.67 
 
 		 75 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  42.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3161  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3013  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0502  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  34.43 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1058  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0820  transcriptional regulator, XRE family  22.97 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0102782 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0925  transcriptional regulator, putative  43.4 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1443  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 199 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0867  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0318952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 182 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  35.94 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5052  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 135 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.514325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3148  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 135 aa  40  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 93 aa  40  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  32.53 
 
 		 222 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>