56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1776 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 79 aa  153  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  44.29 
 
 		 92 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  42.47 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  45.9 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  41.43 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  43.1 
 
 		 183 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 86 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  52.63 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 95 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 72 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1757  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.489894  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  39.66 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  33.9 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  40.68 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  26.09 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  40.68 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  33.9 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  29.03 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  41.79 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1136  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3755  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 78 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 183 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0094  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 85 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.850445  normal  0.0181777 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0677  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 78 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0649  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 78 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1094  hypothetical protein  34.85 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  33.77 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0746  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 72 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.205768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3609  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000857822  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0776  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 72 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.62299  hitchhiker  0.00396946 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>