131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1476 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  67.47 
 
 		 83 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2442  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 86 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0567  XRE family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.102591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003247  putative transcription regulator protein  44.78 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  36.99 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  36.99 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  37.88 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3847  helix-turn-helix domain-containing protein  44.12 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  37.88 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0496  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  37.88 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2034  XRE family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.194194 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  37.04 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0365  helix-turn-helix domain-containing protein  40.51 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0378  helix-turn-helix domain-containing protein  40.51 
 
 		 93 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0367  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0306  transciptional regulator  40.26 
 
 		 93 aa  51.2  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3420  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.964582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4245  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  36.23 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5634  XRE family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909222  normal  0.150315 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4032  helix-turn-helix domain protein  41.18 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.964235  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4613  helix-turn-helix domain protein  36.49 
 
 		 89 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.590277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.14 
 
 		 517 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  35 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  35 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6085  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  39.29 
 
 		 508 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4570  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.27714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  42.55 
 
 		 227 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  37.5 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2646  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1279  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51475  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3380  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.738813  hitchhiker  0.00256975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 115 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  32.2 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  29.35 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1252  putative transcription regulator protein  37.1 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0568  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 304 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.415819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 276 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4068  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 432 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 164 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0970  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1091  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.158888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 68 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 76 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 258 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  39.58 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0168  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 227 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  39.58 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 182 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3867  Cro/CI family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.15 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  29.41 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 118 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0055  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4154  hypothetical protein  41.67 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2319  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288377  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>