36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1196 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  53.85 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  41.1 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  36.23 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  38.96 
 
 		 88 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 86 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  37.88 
 
 		 112 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6254  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.853292 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03585  transcriptional regulator  34.33 
 
 		 206 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4412  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0919942  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6539  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1094  hypothetical protein  37.7 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6581  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1251  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 81 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1824  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  32.79 
 
 		 74 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 87 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  27.94 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 737 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>