60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1916 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  193  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1905  hypothetical protein  97.26 
 
 		 75 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1094  hypothetical protein  43.9 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 97 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  33.85 
 
 		 92 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0427  transciptional regulator  37.88 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3656  transcriptional regulator, XRE family protein  39.71 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  31.67 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0677  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0649  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5133  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.93216  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 86 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  28.21 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 112 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  26.09 
 
 		 79 aa  44.3  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  34.48 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0763  putative DNA-binding protein  33.78 
 
 		 215 aa  42.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  29.51 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  30.65 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 190 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.16 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0814  XRE family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3942  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 188 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  36.51 
 
 		 209 aa  40.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 185 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4620  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 177 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157225  normal  0.499919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4487  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 177 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422127 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>