39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1067 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 86 aa  167  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  78.79 
 
 		 108 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5133  XRE family transcriptional regulator  75.76 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.93216  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  53.52 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6167  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  50.88 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.689241  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.16 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 78 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0649  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0677  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  37.93 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0427  transciptional regulator  41.38 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  46.55 
 
 		 112 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  42.03 
 
 		 87 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4713  hypothetical protein  45.16 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  42.37 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3656  transcriptional regulator, XRE family protein  41.07 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1905  hypothetical protein  36.07 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  33.78 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1094  hypothetical protein  41.27 
 
 		 84 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  36.76 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1338  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 198 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 218 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  37.93 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3478  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1872  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.765913  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3350  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3247  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>