38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0283 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0283  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 99 aa  190  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5937  transcriptional regulator, XRE family  56.41 
 
 		 108 aa  84.7  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.496478  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5133  XRE family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.93216  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 108 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.71 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6167  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  51.56 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.689241  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1430  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 259 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776927 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1094  hypothetical protein  38.81 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  42.42 
 
 		 183 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  43.08 
 
 		 111 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  36.51 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0140  helix-turn-helix domain protein  48.28 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.7168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1905  hypothetical protein  34.92 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  38.67 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30630  transcription regulator protein  39.66 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.635425  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2272  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.29 
 
 		 201 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.306888  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2581  DNA-binding protein  39.29 
 
 		 209 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3469  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4487  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1469  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.978322 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4620  transcriptional regulator, XRE family  33.9 
 
 		 177 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157225  normal  0.499919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 309 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2246  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 197 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01906  hypothetical protein  33.9 
 
 		 180 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.610922  normal  0.293874 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 191 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 276 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  43.18 
 
 		 290 aa  40.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0871  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 331 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 208 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 382 aa  40.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>