177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1005 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 309 aa  607  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  60.67 
 
 		 290 aa  282  5.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  42.3 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  37.46 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  34.65 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  34.54 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  32.91 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 288 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  32.77 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  33.66 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.68 
 
 		 284 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 293 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  32.21 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  36.13 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  37.36 
 
 		 280 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  33.11 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  35.16 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  38.87 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  34.39 
 
 		 284 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  34.77 
 
 		 289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  33.44 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  32.23 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  33.56 
 
 		 291 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 285 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  33.11 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  32.61 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  33.45 
 
 		 284 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  29.78 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  31.58 
 
 		 296 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 287 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  30.79 
 
 		 303 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 292 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 282 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  34.44 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  35.12 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  32.55 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 289 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  32.44 
 
 		 410 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  32.77 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.24 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  31.19 
 
 		 302 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  31.13 
 
 		 287 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  33.22 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  30.58 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  32.65 
 
 		 300 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  31.56 
 
 		 294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  34.08 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  40.3 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  31.72 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  31.37 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  33.75 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  32.57 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  31.16 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  30.92 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 285 aa  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  33.71 
 
 		 276 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  29.53 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  31.89 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  30.74 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 270 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  29.47 
 
 		 293 aa  103  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  30.69 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  30.26 
 
 		 283 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  29.11 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.1 
 
 		 281 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  30.13 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  33.83 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  29.67 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1626  hypothetical protein  32.53 
 
 		 262 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  28.81 
 
 		 308 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 278 aa  93.6  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  30.1 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  32.84 
 
 		 212 aa  92  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  31.56 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.42 
 
 		 282 aa  90.5  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  28.48 
 
 		 293 aa  89.7  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  31.46 
 
 		 297 aa  89.7  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.3 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  32.7 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0418  transcriptional regulator, XRE family  27.15 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  32.24 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  31.62 
 
 		 286 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  29.19 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0902  helix-turn-helix domain protein  29.17 
 
 		 292 aa  86.3  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579826  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3358  hypothetical protein  30.74 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307286  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  28.15 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>