26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0669 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 78 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0677  XRE family transcriptional regulator  97.44 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0649  XRE family transcriptional regulator  97.44 
 
 		 78 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  97.44 
 
 		 97 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  96.15 
 
 		 78 aa  153  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  94.87 
 
 		 97 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0427  transciptional regulator  81.08 
 
 		 82 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3656  transcriptional regulator, XRE family protein  76.92 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 78 aa  120  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 82 aa  92.8  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0433  Cro/CI family transcriptional regulator  72.34 
 
 		 51 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.248324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1067  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.753603 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  36.62 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4541  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1649  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 80 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5133  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.93216  normal  0.775541 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  37.68 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 183 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1905  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  35.09 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 164 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5997  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.21 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4574  XRE family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000193925 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6167  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  36.21 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.689241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>