79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1649 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1649  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 80 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08540  predicted transcriptional regulator  40.32 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1570  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2665  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000943632  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1357  helix-turn-helix domain-containing protein  34.85 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.222468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4552  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  45.61 
 
 		 137 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  39.34 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0677  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0649  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  25 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1573  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0705  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3490  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.23046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0557  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.948289 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3396  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 513 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  35.48 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0427  transciptional regulator  40.74 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0960  DNA methyltransferase  30 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 217 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  43.5  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0415  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.187389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2151  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.194811  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4217  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.538571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3842  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.039108 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0889  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0478  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4980  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.656597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0810  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0185254  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  34.85 
 
 		 517 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 503 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0596  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 231 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6923  XRE family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  25 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2349  hypothetical protein  31.67 
 
 		 69 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0751  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 69 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 64 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5908  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 108 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209414  hitchhiker  0.00928486 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3834  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 		 79 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  28.99 
 
 		 83 aa  41.2  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0549  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 217 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.550111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3341  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.272722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 		 77 aa  41.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  33.93 
 
 		 508 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3352  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3403  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.234277 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5723  transcriptional regulator, XRE family  27.94 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118479  normal  0.785242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  40.74 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2572  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0372  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0794944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2254  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0575156  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3656  transcriptional regulator, XRE family protein  38.18 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3624  XRE family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  33.33 
 
 		 227 aa  40.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  24.62 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 164 aa  40.4  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0498  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5143  putative transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0117731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3593  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.283454  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0407  transcriptional regulator  31.88 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 217 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2445  DNA-binding protein  33.93 
 
 		 101 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.153574  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5565  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 81 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 737 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5293  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 81 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1991  XRE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 69 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0713  ribulose-phosphate 3-epimerase  37.5 
 
 		 81 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.625561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>