37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0377 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0377  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  327  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  0.780883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  52.83 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5665  transcriptional regulator, XRE family  53.52 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0054  hypothetical protein  46.3 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000131489  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 111 aa  50.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0918  hypothetical protein  41.18 
 
 		 67 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00833236  normal  0.201916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1634  hypothetical protein  46.3 
 
 		 69 aa  48.5  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 117 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0805  hypothetical protein  37.25 
 
 		 84 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1729  transcriptional regulator, XRE family  32.71 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114176  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 276 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4570  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 82 aa  45.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  34.02 
 
 		 100 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 258 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 110 aa  43.9  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5258  XRE family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 83 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4233  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4849  XRE family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0669  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0225  hypothetical protein  41.03 
 
 		 111 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2047  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 83 aa  43.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0376  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 82 aa  42.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000453716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 91 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  30.4 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2898  transcriptional regulator, XRE family  30.51 
 
 		 83 aa  41.6  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1274  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 86 aa  41.6  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.329441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0950  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 95 aa  41.6  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0110  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 115 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0078  hypothetical protein  37.1 
 
 		 73 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2636  XRE family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 121 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0267  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 99 aa  40.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5217  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  40.4  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.810491  normal  0.563034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>