70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0326 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 112 aa  224  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0264  XRE family transcriptional regulator  94.64 
 
 		 112 aa  216  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  79.46 
 
 		 112 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  80.36 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  80.36 
 
 		 112 aa  177  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2930  XRE family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.372042  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 111 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  53.64 
 
 		 125 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  52.73 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2398  hypothetical protein  60 
 
 		 80 aa  104  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.550946  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2364  XRE family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1982  XRE family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.497596  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2309  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632006  normal  0.162361 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1916  hypothetical protein  31.67 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  31.25 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  38.18 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4158  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1265  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 203 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.509144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2092  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.209801  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 97 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 220 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7005  transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 212 aa  41.6  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89282 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3022  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1905  hypothetical protein  28.81 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6143  hypothetical protein  36.23 
 
 		 122 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927936  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  40 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0677  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 276 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.244102  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2661  putative transcription regulator protein  30.67 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.574569 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5640  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.731345  normal  0.328925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1918  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0543598  normal  0.812558 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1150  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4210  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0005  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0004  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1509  putative DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221821  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0004  DNA-binding cupin domain-containing protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0004  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1430  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0004  DNA-binding protein  37.5 
 
 		 202 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2282  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.545722  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2401  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 97 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000242769  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4971  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.110875  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  35.85 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5159  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5700  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0785  hypothetical protein  27.08 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00156386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3180  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6889  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.934247 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3114  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935644  normal  0.475898 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4537  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5322  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 203 aa  40  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>