41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1565 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1565  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  284  2e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2058  transcriptional regulator, XRE family  30.1 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1247  XRE family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6229  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4943  helix-turn-helix domain-containing protein  30.48 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04066  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4144  hypothetical protein  37.25 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.182974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2869  hypothetical protein  39.39 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03330  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.312142  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5438  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3718  transcriptional regulator, XRE family  30.93 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2212  hypothetical protein  41.67 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000389536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0476  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0227  transcriptional regulator, XRE family  34.95 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0143  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2078  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1344  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.388374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1911  putative transcription regulator protein  45.83 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3689  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.18369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0180  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0484456  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5343  XRE family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.992998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5011  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.86875 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20520  DNA binding protein, XRE family  47.17 
 
 		 76 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4199  hypothetical protein  29.35 
 
 		 132 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.335436 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7007  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1801  DNA-binding transcriptional regulator HipB  32.81 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0326  transcriptional regulator, XRE family  33.93 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5392  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471231  normal  0.0187132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1840  XRE family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0190  transcriptional regulator, XRE family  29.47 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5342  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.987751 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2959  DNA-binding protein, putative  34.69 
 
 		 130 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4121  helix-turn-helix domain-containing protein  33.78 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1558  transcriptional regulator, XRE family  27.1 
 
 		 114 aa  40  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4462  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 125 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>